يعد التوثيق ثلاثي الأبعاد 3D موردا رقميا قيما للباحثين والمرممين. يتزايد تنفيذ التقنيات ثلاثية الأبعاد في مجال التراث الحضاري في جميع أنحاء العالم نظرًا لأهميته الكبيرة في حفظ وتوثيق مواقع التراث الحضاري والتحف والآثار العالمية المهددة بالتلف أو الضياع. 3D يسمح بإنتاج ألعاب أفلام الرسوم المتحركة وتطبيقات الواقع الافتراضي لمواقع التراث الثقافي التي تم تدميرها أو يتعذر الوصول إليها. إنها أداة تعليمية رائعة وتساعد على زيادة الوعي بالتراث. هدف فريق الـ 3D بالمركز هو توفير مستودع ثلاثي الأبعاد يمكنه الحفاظ على تراث مصر وإنتاج مخرجات ثلاثية الأبعاد تساعد في التعليم ونشر المعرفة التراثية.
من أمثلة أفلام تحريك ثلاثي الأبعاد: معبد دندرة, إدفو، كوم أمبو، والطريق الصاعد لهرم أوناس.